故事设定在一个从未出现过奥特曼与怪兽的地球上。某天，一名外星人意外从宇宙坠落，他手持有着象征身份的红色宇宙回旋镖奥美迦头镖，并有着究极的称号。失去过往记忆的外星人 奥美迦 化身为地球人模样，被人称为宙人。初到地球的宙人，对人类充满好奇，积极主动地接触和了解这些陌生的生命体当神秘巨型生物接连出现时，尘封的记忆碎片被唤醒，宙人认出这些生物正是记忆中的 怪兽。面对怪兽的威胁，强烈的使命感驱使他变身成为奥美迦奥特曼，与怪兽展开战斗。